Fasilitas

MTs Negeri 16 Jakarta memiliki 1 gedung dengan rincian sebagai berikut :

a) 18 Ruang Belajar
b) Ruang Kepala Madrasah
c) Ruang Wakil Kepala Madrasah
d) Ruang PTSP (Pelayanan Terpadu Satu Pintu)
e) Ruang Tata Usaha
f) Ruang Guru
g) Ruang Bimbingan Konseling
h) Ruang Perpustakaan
i) Ruang Lab. Komputer
j) Ruang Lab. IPA
k) Ruang OSIS
l)  Ruang Ekskul
m) Ruang UKS
n) Masjid (dlm proses pembangunan)
o) 7 Petak Kantin
p) Ruang Toko Koperasi
q) Ruang Dapur
r) Pos Security